Los microorganismos causan prácticamente todas las patologías de la pulpa y los tejidos perirradiculares. Para tratar eficazmente las infecciones endodónticas, los clínicos deben reconocer la causa y el efecto de la invasión microbiana del espacio pulpar dental y los tejidos perirradiculares circundantes. Una vez que se ha producido la invasión bacteriana del tejido pulpar, tanto la inflamación inespecífica como la respuesta inmunológica específica del huésped tienen un profundo efecto en la evolución de la enfermedad. El conocimiento del microorganismo asociado a la enfermedad endodóntica es necesario para desarrollar una comprensión básica del proceso de la enfermedad y un fundamento sólido para el tratamiento eficaz de los pacientes con infecciones endodónticas, aunque la gran mayoría de nuestros conocimientos se refieren a las bacterias, ahora somos conscientes de la posibilidad de que la enfermedad endodóntica se considere asociada a hongos y virus. Hoy en día se reconocen más de 300 grupos de especies de bacterias como habitantes normales de la cavidad oral. Las bacterias presentes en los conductos radiculares infectados incluyen un grupo restringido de especies en comparación con la flora total de la cavidad oral.
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