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La microbiologia medica è una branca del campo della microbiologia che si concentra sui microrganismi di interesse medico. come causano le infezioni negli esseri umani, come si diffondono, cosa fanno al corpo umano e come possono essere estirpati. Le persone in questo campo possono lavorare in laboratori di ricerca che studiano i microrganismi, oppure possono lavorare in laboratori diagnostici, eseguendo test per identificare gli organismi che causano malattie nei pazienti e formulando raccomandazioni di trattamento. Questa branca della microbiologia è tra le più studiate e seguite per la sua grande importanza per la medicina. Oltre a fornire una profonda conoscenza e comprensione della natura dei patogeni, questa linea di studio è stata applicata anche in diverse innovazioni immunologiche nel campo della scienza medica. Attraverso lo sviluppo di vaccini contro gli organismi invasori, malattie mortali e debilitanti come il vaiolo, la poliomielite e la tubercolosi sono state eliminate o sono più curabili grazie agli sforzi degli scienziati e dei ricercatori nel campo della microbiologia medica. Batteri, funghi, protozoi e virus possono tutti causare malattie nell'uomo.