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La chiave del successo della terapia parodontale è l'eliminazione dei batteri patogeni dalle tasche parodontali e la creazione di microbioti compatibili con la salute parodontale. L'identificazione di ceppi patogeni sottogengivali nelle gengiviti e nelle parodontiti aiuta la diagnosi delle diverse malattie parodontali. Per questo motivo, è importante eseguire la determinazione sia qualitativa che quantitativa degli agenti patogeni orali in modo da poter determinare la previsione della progressione della malattia e la prevenzione.