Modelagem molecular
Caracterização eletrônica de oligopeptídeos em ¿-hélice
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Nessa obra, os princípios teóricos que regem a modelagem molecular foram aplicados na caracterização eletrônica do oligopeptídeo ¿3 e seus variantes (5Q,7Q)-¿3. Inicialmente, os dipeptídeos lineares e neutros constituintes das biomoléculas mencionados foram modelados e posteriormente otimizados até uma estrutura de menor energia potencial e ângulos diedros adequados. No caso, três processos de otimização geométrica, baseados subsequentemente na teoria clássica newtoniana, na semi-empírica e na teoria do funcional da densidade (DFT), varreram a paisagem de energia de cada dipe...
Nessa obra, os princípios teóricos que regem a modelagem molecular foram aplicados na caracterização eletrônica do oligopeptídeo ¿3 e seus variantes (5Q,7Q)-¿3. Inicialmente, os dipeptídeos lineares e neutros constituintes das biomoléculas mencionados foram modelados e posteriormente otimizados até uma estrutura de menor energia potencial e ângulos diedros adequados. No caso, três processos de otimização geométrica, baseados subsequentemente na teoria clássica newtoniana, na semi-empírica e na teoria do funcional da densidade (DFT), varreram a paisagem de energia de cada dipeptídeos na busca de uma estrutura de energia mínima ideal. Os confôrmeros ótimos foram descritos quanto ao potencial eletrostático, energia de sítio (ionização), orbitais de fronteira HOMO/HOMO-1 e termo de hopping. Um esquema de transporte eletrônico tight-binding foi executado para obtenção dos padrões corrente-voltagem (gráficos IxV) dos modelos em estudo. Os resultados obtidos podem fundamentar pesquisas experimentais com biossensores capazes de diagnosticar doenças a partir do perfil de condutividade elétrica das proteínas do paciente.
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