Quase 100 anos após a descoberta da Corynebacterim pseudotuberculosis, agente etiológico da Linfadenite Caseosa, não existem tratamentos efetivos para esta doença. Neste trabalho é apresentado um estudo em grande escala das proteínas preditas a partir de sequências genômicas de três linhagens de C. pseudotuberculosis, através de técnicas de bioinformática e modelagem molecular comparativa, visando investigar e discutir os seguintes aspectos: (i)quais sequências podem ter suas estruturas tridimensionais geradas e qualificadas por técnicas de modelagem por homologia;(ii)associar a estes modelos proteicos uma classificação enzimática; (iii)inferir possíveis funções biológicas às sequências inicialmente anotadas como hipotéticas, e/ou sugerir uma possível reanotação funcional; (iv)comportamento dinâmico da proteína metaloendopeptidase; (v)identificar o genoma central, acessório e linhagem específico.