Rishee Kalaria, Jay D. Patel

Modellazione omologica insilico della proteina di rivestimento del Papaya ring spot virus

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Produktbeschreibung

In questo studio, la sequenza della proteina di rivestimento è stata analizzata e modellata per esplorare le proprietà e la struttura del Papaya leaf curl virus, del Papaya Mosaic virus e del Papaya ring spot virus-P & W. Poiché non sono disponibili informazioni strutturali per la maggior parte delle sequenze proteiche disponibili nella Protein Data Bank, negli ultimi anni i metodi computazionali per la previsione della struttura delle proteine hanno suscitato grande interesse. Sono state calcolate le proprietà fisico-chimiche della proteina in esame. Per tutti e quattro i ceppi di Papaya virus sono stati rilevati il valore medio di idropatia (GRAVY), il pI, il coefficiente di estinzione, l'indice alifatico e l'indice di instabilità. Questo supporta la proteina ad avere una migliore interazione con l'acqua. La modellazione dell'omologia è stata eseguita con PHYRE2, ModWebe Swiss Model tool. Il modello è stato convalidato utilizzando il software PROSESS, che ha fornito un diagramma di Ramachandran per il ceppo del Papaya virus. Lo studio può aiutare a comprendere la funzione della proteina, il numero e i tipi di epitopi, le porzioni immunogene e l'idoneità alla produzione di anticorpi, agli studi tassonomici, agli studi di valutazione e alla diagnostica del virus.

Produktdetails

• Verlag: Edizioni Sapienza
• Seitenzahl: 72
• Erscheinungstermin: 30. Januar 2023
• Italienisch
• Abmessung: 220mm x 150mm x 5mm
• Gewicht: 125g
• ISBN-13: 9786205650004
• ISBN-10: 6205650002
• Artikelnr.: 67373558

Autorenporträt

O Dr. RISHEE K. KALARIA concluiu o seu doutoramento em biologia molecular e biotecnologia vegetal na Universidade Agrícola de Navsari em 2014. Atualmente, trabalha como Professor Assistente no Instituto de Biotecnologia Aspee Shakilam, Universidade Agrícola de Navsari. É também responsável pela secção de bioinformática.