La décharge à bioréacteur offre plusieurs avantages potentiels, notamment une stabilisation rapide des déchets, une meilleure production de gaz, une meilleure gestion des lixiviats et tous les avantages qui y sont associés. Avec toutes les nouvelles technologies, il y a des inconvénients potentiels. La technologie des décharges à bioréacteur, étant relativement nouvelle dans le domaine de la gestion des DSM, présente des inconvénients potentiels. Comme pour les coûts, les risques comportent un aspect local aux coûts associés aux risques ou à l'évitement des risques. Les risques généraux liés à l'exploitation d'une décharge à bioréacteur sont l'augmentation des émissions de gaz, l'augmentation des coûts d'investissement et d'exploitation, les suintements de lixiviat, la stabilité des pentes, les besoins et les délais de mise en oeuvre, etc.