Existen tantos compuestos orgánicos que puede ser difícil establecer exactamente qué compuestos, o qué combinaciones de compuestos, están presentes en una muestra determinada. Las pruebas químicas pueden servir para distinguir entre los distintos grupos funcionales, y los datos sobre el punto de fusión y el punto de ebullición pueden proporcionar cierta información adicional sobre la identidad y la pureza de un compuesto, pero en general sólo pueden confirmar las estructuras sospechosas y no suelen utilizarse para identificar nuevos compuestos.
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