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Os caracóis marinhos desempenham um papel importante na transmissão de cercaria aos peixes como uma fonte de doenças zoonóticas. O presente estudo teve como objectivo o rastreio dos caracóis recolhidos para a prevalência de infecções cercarianas durante todo o ano, utilizando métodos parasitológicos e genéticos moleculares para 550 caracóis marinhos pertencentes ao género Nerita. A técnica de PCR, utilizando iniciadores específicos de DNA ribossomal (ITS-rDNA) transcritos internamente, foi feita para detectar a prevalência de infecção por trematode larvar em alguns caracóis infectados como controlo positivo e em todos os caracóis não infectados. Os resultados da técnica PCR mostraram uma maior prevalência de infecção (55,82%) do que os métodos clássicos (21,45%). Tais estudos podem ajudar na recolha de dados sobre a relevância ecológica da distribuição da doença nos peixes simpáticos e o padrão de transmissão dos trematódeos digénicos por caracóis e, finalmente, na prevenção e controlo das seguintes doenças de peixes e humanas.