As doenças auto-imunes mais importantes são a artrite reumatóide (AR), e o lúpus eritematoso sistémico (LES). A artrite reumatóide (AR) é uma doença auto-imune crónica, progressiva e inflamatória que está associada a efeitos articulares, extra-articulares e sistémicos. O lúpus eritematoso sistémico (LES) é uma doença de regulação imunitária que resulta numa inflamação crónica que afecta muitos órgãos com a produção de auto-anticorpos.