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Giemsa ist eine metachromatische Färbung, bei der viele Gewebe/Organismen anders gefärbt werden als der Farbstoff selbst. Die Farbstoffmischung - Methylenblau, Azur und Eosinverbindungen - ist blau, aber eine positive Färbung wird durch einen violetten Farbton gekennzeichnet. Giemsa wird häufig zur Identifizierung von Mastzellen verwendet; ihre Granula färben positiv. Auch die immunhistochemischen Färbungen "Mastzell-Tryptase" und "CD 117" werden zum Nachweis von Mastzellen verwendet. Urtikaria und Urticaria pigmentosa gehören zu den Krankheiten, die durch eine deutliche Zunahme des Mastzellvolumens gekennzeichnet sind, so dass Giemsa hier von Nutzen ist. Ein weiterer Grund für den Wert von Giemsa ist die positive Färbung verschiedener infektiöser Organismen, insbesondere Spirochäten, Protozoen und kutane Leishmaniose. Wahrscheinlich wurde eine Färbelösung, die Methylenblau (ein kationischer Thiazinfarbstoff) und Eosin (ein roter anionischer Xanthenfarbstoff) enthält, erstmals 1888 von C. Chenzinsky zum Anfärben von Malariaparasiten in Blutfilmen verwendet. F. Plehn im Jahr 1890 und E. Malachowski und D. L. Romanowsky im Jahr 1891 beschrieben unabhängig voneinander ähnliche Färbelösungen, die Erythrozyten, Leukozyten und Malariaparasiten eine Vielzahl von Farben verliehen.