A nanotecnologia é já um campo de grande importância no tratamento de doenças orais e que a sua aplicação terapêutica no tratamento de canais radiculares irá aumentar nos próximos anos. No entanto, é de notar que a maior parte da investigação sobre nanomateriais dentários são estudos in vitro. Existem poucas publicações que relatam o impacto dos nanomateriais in vivo, e em alguns casos a melhoria resultante da aplicação de nanopartículas é mínima ou ambígua. A falta de estudos fiáveis e a longo prazo, tanto no modelo animal como em ensaios clínicos com pacientes, é um desafio e requer cuidados especiais com a sua utilização. A nanotecnologia pode quebrar barreiras à tecnologia convencional no campo da endodontia.