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Ballaststoffe sind der wichtigste Faktor, der die menschliche Biologie und Speziation beeinflusst. Ballaststoffe und Humanarzneimittel - Antibiotika und Nicht-Antibiotika - können die Darmflora modulieren und so das Wachstum von Dickdarmarchaeen und die Endosymbiose fördern, was zu Klimaveränderungen, der Entwicklung von Superbugs und neu auftretenden Viren führt und den Phänotyp von Krankheiten hervorruft. Eine ballaststoffreiche Ernährung wird von der Darmflora verdaut, was zur Bildung kurzkettiger Fettsäuren führt und das Wachstum von Endosymbionten und Kolonarchaeen hemmt. Eine ballaststoffarme Ernährung mit erhöhtem Protein- und Fettgehalt führt zu einer Stimulierung des Wachstums von Endosymbionten und Kolonarchaeen. Somit verändert eine ballaststoffarme Ernährung das Darmmikrobiom im Dickdarm und fördert das Wachstum von Archaeen. Die Archaeen entwickeln schützende Mechanismen der Antibiotikaresistenz und dominieren die Mikroflora des Dickdarms. Die Dickdarmarchaeen übertragen durch natürliche Selektion und DNA-/Gen-Austausch mit anderen Dickdarm- und endosymbiotischen Organismen die Gene für die Antibiotikaresistenz auf andere Dickdarmflora. Dies bildet die Grundlage für die Entstehung von Superbugs, die gegen alle Antibiotika resistent sind. Ballaststoffe und natürliche Produkte können als Antibiotika wirken.