Les champignons endophytes, les mycètes, ou les moisissures ont un rôle très important dans le monde microbien. Ils présentent un intérêt économique, en raison de leur utilité ou de leurs activités néfastes multiples. La présente étude menée dans trois pépinières représentatives de la wilaya de Tlemcen vise à: (i) inventorier de la flore fongique telluriques qui existe dans le rhizosphère des jeunes plantules, (ii) identifier les espèces isolées sur la base des données culturels et microscopiques, (iii) tester l'effet antagoniste de quelques isolats de Trichoderma sp. sur les espèces du genre Pythium sp. et celles de Diplodia sp. La méthode de dilution a révélé la présence d'une biodiversité fongique importante sur le milieu PDA pour les trois sites prospectés. Dix-sept espèces fongiques ont été isolés et identifiées à savoir: P. cinnamomi, P. gonapodyides, P. ramorum, D. sapinea, Lasio. Exigua, Py. ultimum, Py. polare, F. oxysporum, Aspergillus sp, Penicellium sp., Mucor sp. Trichoderma sp. et Alternaria sp.Une importante activité antagoniste a été enregistrée pour les isolats de Trichoderma sp. contre les espèces de Pythium sp. et Diplodia sp.
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