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La ricerca ecologica si basa sulla misurazione di parametri importanti negli organismi e sui fattori ambientali con cui interagiscono. Questo si chiama campionamento. Nella maggior parte dei casi, è impossibile misurare tutti gli organismi o le diverse parti dell'ambiente coinvolte in uno studio. Il campionamento presuppone un processo di selezione degli organismi o degli ambienti da misurare. Il cosiddetto "campione" deve rappresentare effettivamente i gruppi marini selezionati. Tuttavia, la rappresentatività del campionamento varia a seconda della dimensione del campione (numero di campioni), e secondo la distribuzione spaziale e temporale degli organismi in studio. Lo sforzo di campionamento è un compromesso tra la minimizzazione dello sforzo durante la fase di raccolta dei dati e la massimizzazione dell'affidabilità delle conclusioni derivate da questi dati. I principi e le procedure per il campionamento degli organismi bentonici marini sono riassunti qui.