A aplicação do HIS em hospitais na tomada de decisões tem vários desafios, incluindo a falta de actualização dos componentes de hardware e software Além disso, a ausência de um específico, centrado no desenvolvimento do seu pessoal técnico, e a mobilização de recursos financeiros para conseguir uma implementação adequada. Por conseguinte, recomenda-se o estabelecimento de uma gestão técnica com papéis e tarefas claras e multidisciplinares, e o aumento do apoio da liderança administrativa no processo de implementação do SIH.A aplicação de informação de saúde informatizada nos hospitais ajudará a liderança e a organização a escolher decisões altamente qualificadas, dependendo dos dados baseados em provas, as decisões médicas e administrativas melhoram continuamente e o processo de falha será reduzido.A eficácia e eficiência financeiras serão melhoradas e a gestão será mais executada.