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A criptosporidiose é uma parasitose emergente devido a um protozoário intracelular, Cryptosporidium sp. O objectivo do nosso trabalho foi determinar a prevalência do Cryptosporidium sp em sujeitos com diarreia, sendo um estudo prospectivo descritivo, transversal e analítico que foi realizado durante um período de 05 meses de 01/10/2016 a 28/02/2017. Concentrou-se nas amostras de fezes enviadas para o laboratório de parasitologia do Hospital Universitário de Constantino. Cada fezes beneficiou de concentração e coloração (Ziehl Nelseen modificado) para Cryptosporidium sp. oocysts. Entre as 80 amostras de fezes examinadas durante o período do nosso estudo, 6 foram positivas com uma taxa de 7,5%. A maioria dos pacientes eram adultos de 37-50 anos, apenas uma criança de 2 anos de idade foi recolhida. Metade dos casos eram sujeitos frágeis (HIV+, criança de 2 anos, episódio de amebíase). No nosso estudo, o exame microscópico foi o único meio de diagnóstico; o uso da PCR para fazer o diagnóstico e identificar as espécies envolvidas seria desejável.