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A pectinase foi uma das primeiras enzimas a ser empregada comercialmente em vários sectores que remontam a 1930. As pectinases microbianas representam 25% de todas as vendas mundiais de enzimas alimentares. As pectinases são actualmente as principais enzimas no sector comercial. Está provado que, em vez de utilizar estirpes de alto rendimento, o custo de produção pode ser reduzido utilizando condições ideais de fermentação e matérias-primas baratas como fonte e substrato de carbono.