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A natureza é uma fonte atractiva de novos compostos terapêuticos, uma vez que uma enorme diversidade química é encontrada em milhões de espécies de plantas, animais, marinhos e microrganismos. A exploração de microrganismos para produzir ingredientes alimentares tem vindo a acontecer desde a antiguidade. Estes estão a ser utilizados para a produção em larga escala de uma variedade de bioquímicos, desde o álcool aos antibióticos e ao processamento de alimentos para consumo humano e animal. Os microrganismos têm grande potencial como nutracêuticos e podem ser utilizados no combate a doenças como a desnutrição proteica energética (PEM), anemia, diarreia, cancro, obesidade, colite ulcerosa, doença de Crohn, síndrome do intestino irritável e celíaca resistente à terapia do glúten. São também potenciais fontes de antioxidantes, corantes naturais, vitaminas, enzimas, antibióticos e podem ser utilizados como sinbióticos. Os micróbios têm também um enorme potencial para a gestão de doenças como a diabetes e podem curar até alergias e aliviar problemas de stress.