As doenças sistémicas e as infecções orais estão intimamente relacionadas porque ambas partilham muitos factores de risco associados. As condições gerais de saúde de um doente podem influenciar a cura de lesões periapicais e, por conseguinte, o resultado do tratamento do canal radicular. Tanto os factores sistémicos como os baseados nos dentes podem ter um impacto negativo no sucesso do tratamento endodôntico.O resultado do tratamento de infecções endodônticas pode ser mais pobre em pacientes com condições médicas gerais, tais como diabetes mellitus, hipertensão, doenças renais, condições imunossupressoras, etc. Factores de base dentária, tais como a qualidade da preparação químico-mecânica do canal radicular, a qualidade da obturação do canal radicular, bem como a existência pré-operatória de lesões periapicais, são também factores significativos para o sucesso do tratamento do canal radicular. Os dentistas devem estar conscientes da relação entre as condições sistémicas, as perturbações e os resultados do tratamento endodôntico, porque isto pode ter influência no resultado da cura em vez de actuar apenas como um factor etiológico causal, e fornece informações valiosas sobre o prognóstico do tratamento endodôntico.