Ao longo dos anos, o papel do ortodontista na fissura labial e palatina tem sido múltiplo, devido ao seu sinergismo com outras necessidades de tratamento do paciente. O ortodontista pode participar durante todas as fases de tratamento de pacientes com fissuras: Nas fases iniciais com ortopedia pré-cirúrgica da maxila; durante as fases intermédias pelo alinhamento dos segmentos maxilares e dentição e preparação para enxerto ósseo alveolar secundário; durante as fases finais pela obtenção da relação dentária ideal e preparação da dentição para reabilitação protética ou cirurgia ortognática. O papel do ortodontista na calendarização e sequência do tratamento é importante em termos de gestão global da equipa. O ortodontista deve tomar decisões críticas para a intervenção ortodôntica no momento apropriado e dar prioridade aos objectivos de tratamento para cada intervenção, pois o objectivo da reabilitação completa de pacientes com fissuras é minimizar as intervenções e maximizar o resultado do tratamento.