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Capsicum frutescens (Familia: Solanaceae) es una hierba anual o perenne de vida corta. El tallo de C. frutescens es casi estriado, glabro, y su altura oscila entre 1 y 4 pies, según el clima y las condiciones de cultivo. C. frutescens, popularmente llamada "lavanga o mugilu menasinakai" en Karnataka, es una variedad muy picante con frutos muy pequeños y con un contenido máximo de capsaicina. En este estudio se seleccionaron diez variedades diferentes en función del color de los frutos: verde, blanco, amarillo, naranja, rojo y marrón. Los frutos son erectos, pequeños, fusiformes, ovalados y semiovalados, y son variantes según su morfología y color. El ADN polimórfico amplificado aleatoriamente es un método rápido y útil de marcado del genoma que resulta útil para estudios sobre taxonomía de especies hermanas y estructuras genéticas intraespecíficas de la población. Las diferencias en las huellas de ADN obtenidas mediante RAPD-PCR mostraron una mayor diversidad genética entre las variantes recolectadas de C. frutescens se evaluaron visualmente. Se incluyeron en el análisis los polimorfismos que incluían bandas tenues que podían puntuarse de forma inequívoca. Este estudio nos permitió determinar el análisis de la diversidad genética mediante la técnica basada en RAPD-PCR.