La gestion intégrée des ressources en eaux interfère, directement ou indirectement, avec la conservation de la biodiversité. Parmi les principaux problèmes de gestion de l'eau au Maroc, il est à signaler la pollution et la perte des écosystèmes aquatiques ; ce qui nécessite l'intégration de la phytodiversité dans la gestion des eaux. Ce travail contribue à la connaissance de la végétation et de la phytodiversité des cours d'eau, et du bassin versant de l'oued Inaouène et environs (Nord-ouest du Maroc). Il met en évidence des impacts de l'anthropisation sur la végétation ripicole et les ressources en eaux. Il contribue aussi au développement d'outils d'aide à la décision, en matière de gestion des eaux de surface. Nous avons procédé via des prospections socio-économiques de la végétation, des relevés de données morphologiques et physico-chimiques de cours d'eau, et des relevés phytosociologiques de la végétation riveraine. Les rejets des eaux usées, les travaux d'aménagements, l'exploitation de la phytomasse ... sont des facteurs affectant la qualité du milieu. Ce qui nécessite une gestion intégrée des ressources en eaux en concertation, entre autres, avec la population locale.