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Aproximadamente dos tercios de las publicaciones en química tratan de un modo u otro de los heterociclos, debido a su diversidad estructural. Sus propiedades y las innumerables virtudes que los caracterizan. Un gran número de sustancias y medicamentos naturales o sintéticos son, de hecho, heterociclos.Varios compuestos heterocíclicos tienen aplicaciones en agricultura como insecticidas, fungicidas, herbicidas, pesticidas, etc. También tienen aplicaciones como sensibilizantes, reveladores, antioxidantes, copolímeros, etc. Se utilizan como vehículos en la síntesis de otros compuestos orgánicos.La mayoría de los productos farmacéuticos se basan en heterociclos y, entre las diversas aplicaciones clínicas, los compuestos heterocíclicos tienen un papel activo considerable como fármacos antibacterianos, antivirales, antifúngicos, antiinflamatorios y antitumorales.
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