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Durante la pubertad, el hipotálamo libera pulsátilmente la Hormona Liberadora de Gonadotropinas (GnRH), estimulando la síntesis y secreción de la Hormona Luteinizante (LH) y la Hormona Estimulante del Folículo (FSH) en la pituitaria anterior. En mujeres con Amenorrea Hipotalámica Funcional (FHA), se observa una supresión de GnRH, alteraciones en la pulsatilidad de LH y una disminución de los niveles de LH y FSH, lo que genera una producción ovárica reducida de estradiol, progesterona y testosterona, acompañada de anovulación y amenorrea. Este trastorno del eje hipotalámico-hipofisario-ovárico puede ser provocado por estrés psicológico, trastornos de la conducta alimentaria, pérdida de peso o ejercicio excesivo. Particularmente en deportes donde el peso es crucial, el ejercicio excesivo se asocia con FHA, subrayando la importancia de la nutrición deportiva en su prevención y tratamiento. El diagnóstico de FHA, vinculado a una baja disponibilidad energética, es de exclusión, y suele confundirse con el síndrome de ovario poliquístico (SOP), lo que puede llevar a intervenciones nutricionales inadecuadas que dificultan la recuperación del ciclo menstrual y la salud general.