Factoren die de samenstelling en relatieve abundantie van fytoplanktongemeenschappen reguleren werden onderzocht in een oud meer met een zeer endemisch voedselweb. Het Matano-meer heeft een diversiteit aan geslachten (21) vergelijkbaar met tropische meren, maar een lage fytoplanktonbiomassa (0,0162 µg/L). Verticale menging beperkt fysisch de primaire productie (42% Zeu:Zm); fytoplankton wordt verplaatst tot onder de eufotische zone. De concentraties van macronutriënten (0,30 µmol/L N, 0,13 µmol/L P) zijn laag. Bioassays met nutriënten gebruikten N en P (30-320 µmol/L afzonderlijk, 60:5-1920:160 µmol/L N:P gecombineerd). Na 16 dagen traden er geen significante (p > 0,05) veranderingen op in de relatieve abundantie en geen biologisch significante veranderingen in de fytoplanktonbiomassa. De CHU-10 groeimedia kweek verhoogde echter significant de chl-a. Uit analyses bleek dat Cr (0,14 µmol/L) in het meerwater boven de drempelwaarde lag om de groei van algen te beperken (0,12 µmol/L) en Mo (0,0005 µmol/L) onder de behoefte van de meeste waterorganismen (0,008 µmol/L). Derhalve wordt geconcludeerd dat fysische (menging) en chemische (toxiciteit, micronutriënten) factoren de samenstelling en relatieve abundantie van fytoplankton in Matano beperken.