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Este livro apresenta um novo sistema para a reconstrução automática de superfícies corticais a partir de imagens de ressonância magnética ponderadas em T1. No centro do sistema está uma estrutura unificada de análise Reeb para a deteção e remoção de anomalias geométricas e topológicas nos limites dos tecidos. Usando a análise intrínseca de Reeb, o sistema pode identificar a localização de ramos espúrios e outliers topológicos, e rectificá-los com filtragem localizada usando informações de ambas as distribuições de intensidade de imagem e regularidade geométrica. Este sistema desenvolve uma classificação de tecidos melhorada com caraterísticas Hessianas para uma maior robustez à falta de homogeneidade da imagem e interpolação adaptativa para obter uma precisão sub-voxel nas superfícies reconstruídas. Ao integrar estes novos desenvolvimentos, foi concebido um novo sistema. O sistema pode reconstruir automaticamente superfícies corticais com uma qualidade melhorada e um custo computacional drasticamente reduzido em comparação com o popular software Free Surfer. Em comparação com o Free Surfer, o trabalho apresentado mostra que o sistema é capaz de gerar superfícies que representam melhor a anatomia cortical e produzir caraterísticas de espessura com maior poder estatístico em estudos populacionais.