Un renovado interés internacional se ha centrado en los tintes naturales debido a la mayor concienciación sobre los riesgos medioambientales y sanitarios asociados al uso de tintes sintéticos. Existe un interés por el desarrollo de pigmentos obtenidos a partir de fuentes naturales. Los tintes naturales son en su mayoría ecológicos, biodegradables, menos tóxicos y menos alergénicos en comparación con los tintes sintéticos. Recientemente se han realizado esfuerzos de investigación para sustituir los pigmentos sintéticos por pigmentos naturales procedentes de plantas, animales y microorganismos. Algunos pigmentos microbianos tienen numerosas propiedades beneficiosas como anticancerígenas, antiproliferativas, inmunosupresoras, antibióticas, biodegradables, etc. Muchos microorganismos, entre ellos bacterias, hongos y levaduras, se emplean para la producción industrial de diversos pigmentos mediante la tecnología de la fermentación. Los estudios recientes se interesan por los pigmentos producidos por microorganismos, como los carotenoides, las melaninas, las flavonas, las quininas, las prodigiosinas y las monascinas. Muchas levaduras como Rhodotorula (rosa), Yarrowialipolytica (marrón), Cryptococcus (rojo) y Phaffiarhodozyma (carotenoides) son una buena fuente de pigmentos microbianos.
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