La présente étude avait pour objectifs de mettre en place un système de surveillance de la résistance aux antimicrobiens des souches d'E.coli isolées au Laboratoire R. Mérieux de 2016 à 2017. Durant l'étude 402 bacilles à gram négatif ont été identifiés parmi lesquelles les entérobactéries représentaient 92%, E.coli était le germe le plus isolé (49%). Le pourcentage d'isolement de l'espèce à partir des prélèvements urinaires était plus important (62,5%). Dix-huit pour cent (18%) des souches étaient productrices de BLSE. La résistance aux antibiotiques a été observée à plusieurs niveaux de familles d'antibiotiques : Les béta-lactamines, les aminosides et les quinolones. L'imipenème, la fosfomycine et la nitrofurantoine étaient les molécules les plus actives. Les souches isolées des urines étaient fortement productrices de BLSE (58,33%). Les souches isolées dans les échantillons des patients en provenance des structures de santé communautaires produisaient plus de BLSE et de phénotypes sauvages soit 38,89% et 70,83% respectivement. L'augmentation de la résistance aux antibiotiques a considérablement augmenté ce qui rend la prise en charge des infections à Escherichia coli difficile.