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L'approccio computazionale alla progettazione di farmaci ha un grande potenziale nell'accelerare il processo di scoperta dei farmaci. La progettazione di farmaci basata sulla struttura e la progettazione di farmaci basata sui ligandi sono le due grandi classi di progettazione computazionale di farmaci. Il cancro è una classe di malattie altamente complesse che coinvolgono più geni e molteplici collegamenti incrociati tra le reti di segnalazione. Le cellule cancerose possono svilupparsi da difetti ereditari o da danni acquisiti del DNA. Tuttavia, molti tumori sono resistenti al trattamento e le metastasi rendono la malattia ancora più intrattabile. Dopo la chemioterapia si osservano spesso tumori secondari. La richiesta di una terapia antitumorale più efficace è d'obbligo. L'uso di cocktail di farmaci che combinano più agenti antitumorali che lavorano con meccanismi diversi è stato un trattamento standard dei tumori per superare il problema della resistenza ai farmaci. Più recentemente, la progettazione di ligandi multipli (che possono essere più facilmente intesi come "ligandi a bersaglio multiplo"), cioè di singoli agenti che mirano a più biomolecole in modo razionale, riceve un'attenzione crescente. Vengono esaminati alcuni recenti sviluppi metodologici sulla progettazione computazionale di farmaci e vengono riassunti alcuni recenti sforzi di progettazione di farmaci in campo oncologico.