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Nell'industria, gli enzimi sono stati usati come strumenti per catalizzare operazioni specifiche e uniche per ottenere prodotti di importanti applicazioni. Le proteasi, come un unico gruppo di enzimi, hanno avuto un'ampia applicazione nelle industrie farmaceutiche per il loro uso diretto come collagenasi (rimozione di coaguli di sangue), tripsina e chimotripsina (antinfiammatori) o l'uso dei loro prodotti come nelle formule di alimentazione idrolizzate per i bambini e i pazienti immunodepressi. Gli enzimi immobilizzati sono spesso più stabili di quelli liberi. Essi forniscono importanti vantaggi, come il riutilizzo dell'enzima per molti processi e possono essere impiegati in una vasta gamma. La separazione dell'enzima immobilizzato da altri componenti della miscela di reazione è semplificata.