A cana-de-açúcar (Saccharum officinarum L.) é uma das principais culturas do mundo. A caracterização molecular e a selecção assistida por marcadores moleculares na cultura da cana-de-açúcar pode ser um instrumento para a melhoria desta cultura pode ajudar a aumentar a produção de açúcar. Como muitas outras espécies vegetais, os tecidos da cana de açúcar contêm altos níveis de polissacarídeos e compostos polifenólicos, que apresentam um grande problema de contaminação durante a purificação do ADN. Elevadas concentrações de polissacarídeos, que co-purificam com o ADN em extracções normais de fenol-clorofórmio e polifenóis ligam-se covalentemente ao ADN, tornando-o inútil para a maioria das aplicações de investigação. Um procedimento rápido, eficiente e fácil de purificação do ADN da cana-de-açúcar é uma necessidade urgente nos programas de mapeamento do genoma e selecção assistida por marcadores (MAS). Na presente investigação foi desenvolvido um método eficiente e fácil para o isolamento de ADN de alta qualidade do cilindro de meristema da cana de açúcar. Com o método desenvolvido foi possível o isolamento de ADN de alta qualidade sem utilização de nitrogénio líquido, homogeneizador de tecidos e utilizando uma simples microcentrífuga. ADN isolado bem realizado para amplificação por PCR e impressão digital de ADN utilizando marcadores RAPD.