Alors que les résultats de la recherche en neurosciences influencent profondément de nombreux aspects de notre vie, depuis la compréhension théorique de la base biologique de l'esprit jusqu'à l'application clinique de la recherche scientifique, les fondements conceptuels de ce domaine n'ont reçu que peu d'attention. La recherche empirique a généré un grand nombre de résultats expérimentaux, mais ces connaissances doivent encore être intégrées dans une image convaincante de la manière dont les processus cognitifs, affectifs et moteurs sont engendrés et contrôlés par le cerveau. Les limites proviennent en partie de la difficulté intrinsèque de produire une théorie unifiée des fonctions cérébrales. Cet examen épistémologique des neurosciences cognitives a pour but de définir certaines questions centrales soulevées par ce domaine passionnant, ainsi que d'organiser les réponses possibles à ces questions. Il s'agit également d'un registre historique des questions épistémologiques en neurosciences soulevées à la toute fin du XXe siècle, servant de référence pour la comparaison avec les avancées obtenues au cours du nouveau millénaire. Ces questions méritent l'attention des neuroscientifiques contemporains, des philosophes des sciences et de tous ceux qui s'intéressent aux approches interdisciplinaires des fonctions cérébrales.