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La filosofía es la cuestión principal de la ciencia, siempre que se quiera investigar un tema desde el punto de vista de la filosofía, las mentes de los sabios se plantearán las preguntas generales y principales al respecto. Aunque hoy en día la filosofía se considera una ciencia independiente en todo el mundo las ciencias naturales se han originado a partir de la filosofía natural. La química es una de las ciencias naturales en la que se estudian los elementos, átomos, moléculas y otras estructuras químicas, así como su comportamiento en las reacciones y sus características. Desafortunadamente, la química ha tenido algunos lados oscuros en la historia y ha sido ignorada por otras especialidades en la medida en que algunos de los estudiosos prefieren no considerar la química o su filosofía como una ciencia independiente. No considerar la química y su filosofía de forma autónoma ha estado obligando a los químicos a escribir y publicar valiosos libros, artículos y descubrimientos lo que son sobre la química y su filosofía ontología y metodología.