Le piantagioni commerciali di papaya sono solitamente propagate da semi selezionati dai produttori da piante ermafrodite con caratteristiche desiderabili. Tuttavia, lo sviluppo della coltura è stato limitato da vari fattori, principalmente quelli legati alla natura dioica ed eterozigote della specie e alla mancanza di metodi commerciali per la moltiplicazione vegetativa. Con le tecniche di coltura tissutale e di mini-trapianto, è possibile sfruttare molte specie a propagazione asessuata. Poiché la produzione di propaguli clonali può essere ottenuta rapidamente, la coltura può essere stabilita con una sola piantina per foro con piante ermafrodite al 100%, fornendo una produzione su larga scala di cloni con caratteristiche superiori, sessi definiti e privi di virus, nonché di piante ottenute attraverso incroci incompatibili e transgenici. La minipuntura è un'altra tecnica di grande applicabilità nella propagazione vegetativa. Entrambe le tecniche consentono una produzione più precoce, una minore altezza di inserzione del primo fiore, un'elevata produttività e l'uniformità dei frutti.
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