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O feijão-frade é a cultura mais importante nas regiões tropicais e subtropicais. Neste estudo, foram estudadas as caracterizações moleculares e morfológicas de 32 genótipos de feijão-frade em condições de stress hídrico. Os critérios indicadores associados ao stress hídrico, como o rendimento biológico, o peso de 100 grãos, o número de sementes por vagem, as vagens por planta e o índice de colheita, foram examinados em condições de campo. Os resultados mostraram que os genótipos 7, 210, 291 e 313, juntamente com os controlos (Mashhad e Parasto), foram identificados como genótipos tolerantes com o rendimento mais elevado. A análise molecular utilizando 22 pares de iniciadores SSR detectou um total de 186 alelos e uma distância genética de 0,0066 entre genótipos. O maior fluxo genético e PIC foram detectados para os primers vm68 (14,88) e vm25 (0,625), respetivamente. A análise mostrou que os primers relacionados com o rendimento económico e biológico em condições normais e de seca foram Vm70, Vm33 e Vm3, Vm26, respetivamente. Esta investigação destina-se a investigadores agrícolas, biotecnólogos, agricultores, estudantes de agricultura e professores de agricultura, que certamente a acharão útil.