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Las arqueas humanas endosimbióticas y colónicas secretan virus ARN y ADN y sirven de reservorio para ellos. Los viroides arqueales secretan virus envueltos como el SARS, el MERS, el corona y el VIH. Las arqueas colónicas y endosimbióticas también generan viroides de ARN que son convertidos en viroides de ADN por la transcriptasa inversa HERV del epitelio colónico y se integran en el genoma colónico. Los viroides de ARN y ADN se hibridan con la población viroidal y bacteriana del microbioma intestinal y con los virus de ADN y ARN del virobioma intestinal, lo que da lugar a la generación de nuevos virus emergentes. Los viroides de ARN arqueal pueden hibridarse con el ARN mitocondrial generando nuevos virus y las mitocondrias libres pueden convertirse en una red de soporte viral de células infecciosas. Los viroides de ARN arqueal que se hibridan con el ARN mitocondrial pueden convertirse en ADN mitocondrial mediante la transcriptasa inversa y formar parte del ADN mitocondrial. Pueden formar supermitochondria y superbacterias. Estas supermitochondrias hibridadas con virus ARN pueden replicarse por fisión y fusión y formar una red fuera de la estructura celular que regula el cuerpo y el cerebro.