L'étude a comparé la rentabilité du système coton (coton et cultures de rotation) selon les trois modes de production (conventionnel, biologique et transgénique). Elle s'est déroulée au Burkina Faso sur un échantillon de 180 exploitations dont 60 de chaque système. Il ressort des résultats que les coûts de production des diverses spéculations en modes de production transgénique et conventionnel sont plus élevés que ceux du mode biologique. Sur le plan de la rentabilité, il n'y a pas de différence significative entre les marges dégagées par les différents modes de production du coton. En somme, la production du coton biologique apparaît comme une option viable sur le plan socioéconomique et pourrait être considérée comme une opportunité dans la lutte pour l'éradication de la pauvreté dans le contexte particulier de changement climatique.