O propósito deste trabalho foi testar o uso de marcadores moleculares microssatélites (SSR) para auxiliar a seleção de híbridos em programas de retrocruzamento (RC) em milho. A característica escolhida foi altura de espiga (AE) e para isso, selecionou-se duas linhagens contrastantes. A L11 foi o genitor recorrente por apresentar uma excelente capacidade geral de combinação para produção de grãos e uma alta inserção da espiga, e a L13 a doadora por possuir uma baixa inserção de espiga. Obteve-se a geração F1 e o primeiro ciclo de RC avaliadas quanto a AE. Selecionou-se 35 plantas a serem genotipadas com 27 marcadores SSRs. Em cada geração de RC foram selecionadas plantas para comporem um topcross, usando a linhagem L161 como testadora. Os híbridos obtidos tiveram produção superior à testemunha (P30F33), em todos os ambientes, mostrando o potencial produtivo dos híbridos testados. Constatou-se que os programas de RC assistidos por SSR são uma estratégia confiável quando se deseja reduzir o tempo e aumentar a eficiência da seleção, uma vez que foram identificadas plantas com elevado grau de recuperação do genótipo recorrente nos ciclos iniciais do processo de RC.