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Les archées humaines endosymbiotiques et coliques sécrètent des virus à ARN et à ADN et leur servent de réservoir. Les viroïdes archéologiques sécrètent des virus enveloppés tels que le SRAS, le MERS, le corona et le VIH. Les archées coliques et endosymbiotiques génèrent également des viroïdes à ARN qui sont convertis en viroïdes à ADN par la transcriptase inverse HERV de l'épithélium colique et s'intègrent dans le génome colique. Les viroïdes ARN et ADN s'hybrident avec la population viroïde et bactérienne du microbiome intestinal et avec les virus ADN et ARN du virobiome intestinal, ce qui entraîne la création de nouveaux virus émergents. Les viroïdes archéologiques à ARN peuvent s'hybrider avec l'ARN mitochondrial, générant de nouveaux virus, et les mitochondries libres peuvent devenir un réseau de soutien viral efficace pour les cellules infectieuses. Les viroïdes à ARN archéologique qui s'hybrident avec l'ARN mitochondrial peuvent être convertis en ADN mitochondrial par la transcriptase inverse et peuvent faire partie de l'ADN mitochondrial. Ils peuvent former des supermitochondries et des superbactéries. Ces supermitochondries hybridées avec des virus à ARN peuvent se répliquer par fission et fusion et former un réseau à l'extérieur de la structure cellulaire qui régule le corps et le cerveau.