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Con todos los avances de la biología molecular, puede parecer sorprendente descubrir que los métodos tradicionales de fitomejoramiento siguen siendo necesarios en el desarrollo de variedades vegetales. En la actualidad, el procedimiento de retrocruzamiento se utiliza con mayor frecuencia para trasladar un transgén de una buena variedad de cultivo de tejidos que se utilizó en la transformación a una línea o variedad experimental de élite. El retrocruzamiento es más eficiente que la transformación de la línea de élite porque la mayoría de los protocolos de transformación están optimizados para una línea de laboratorio específica (a menudo mal adaptada y de menor rendimiento). Muchas líneas de élite (de alto rendimiento) no se pueden transformar. Por ello, los ingenieros genéticos transforman su línea de laboratorio y los criadores retrocruzan el trangén de la línea de laboratorio en la línea de élite. La selección asistida por marcadores es un proceso de selección indirecta en el que un rasgo de interés se selecciona sobre la base de un marcador vinculado al rasgo de interés El retrocruzamiento asistido por marcadores (MABC) La selección de fondo puede acelerar en gran medida el programa de retrocruzamiento en comparación con el uso del retrocruzamiento convencional.