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Com todos os avanços da biologia molecular, pode parecer surpreendente descobrir que os métodos tradicionais de cultivo de plantas ainda são necessários para o desenvolvimento de variedades vegetais. Hoje em dia, o procedimento de retrocruzamento é mais utilizado para mover um transgene de uma boa variedade de cultura de tecidos que foi utilizado na transformação para uma linha ou variedade experimental de elite. O retrocruzamento é mais eficiente do que a transformação da linha de elite porque a maioria dos protocolos de transformação são otimizados para uma linha específica (muitas vezes mal adaptada e de baixo rendimento) de laboratório. Muitas linhas de elite (que são de alto rendimento) não são passíveis de transformação. Assim os engenheiros genéticos transformam a sua linha de laboratório e os criadores cruzam o trangene da linha de laboratório para a linha de elite. A seleção assistida por marcadores é um processo de seleção indireta onde um traço de interesse é selecionado com base no marcador ligado ao traço de interesse O backcrossing assistido por marcadores (MABC) A seleção de fundo pode acelerar muito o programa de backcrossing em comparação com o uso do backcrossing convencional.