O Burundi é dotado de uma grande riqueza de ecossistemas naturais e de biodiversidade vegetal e animal, principalmente devido à diversidade das condições ecológicas. Está dividido em 11 regiões naturais que podem ser agrupadas em cinco zonas ecológicas: a planície de Imbo, a oeste; a cordilheira do Congo-Nilo; o planalto central; a depressão de Moso, a leste; as escarpas de Mumirwa e a depressão de Bugesera, a nordeste.