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L'infezione primaria da HIV si riferisce a due entità, l'infezione acuta da HIV che si verifica in individui prima dello sviluppo di una risposta anticorpale e l'infezione precoce da HIV in cui gli individui si sono sieroconvertiti ma sono ancora in una fase iniziale dell'infezione. La comprensione della patogenesi dell'infezione acuta e precoce da HIV potrebbe identificare nuove strategie in grado di modificare il tasso di progressione della malattia e ridurre la trasmissione secondaria. Un problema di portata nascosta è quello della sifilide e dell'HIV, dove la presenza della sifilide in una persona fa sì che il rischio di acquisire l'HIV sia da 3 a 9 volte più probabile rispetto a una persona che non ce l'ha, e fa sì che il comportamento nei confronti dell'HIV modifichi la sintomatologia delle IST. Un problema con l'HIV è che tutte le persone infette generano anticorpi rilevabili entro uno o tre mesi dall'infezione, e a volte per periodi più lunghi, fino a 6 mesi, e solo alcuni casi finiscono per generare anticorpi dopo questo periodo, quando prende il nome di sieroconversione in 364 lavoratori del sesso che sono stati testati per l'HIV e la VDRL presso l'INH Machala da gennaio a dicembre 2008.