Severine Jancek

Signature génomique de 3 écotypes d'Ostreococcus, algues Prasinophytes

Analyse de leur génome

• Broschiertes Buch

Produktbeschreibung

Le genre Ostreococcus regroupe les plus petits organismes eucaryotes photosynthétiques connus à ce jour. Les génomes complets de 3 écotypes d'Ostreococcus, isolés à partir de 3 niches écologiques différentes, ont été séquencés. Ces écotypes correspondent à une souche de surface adaptée à une forte luminosité, une souche profonde adaptée à une faible luminosité, et une souche de surface polyvalente à la lumière. La comparaison des génomes a révélé une divergence en acides aminés inattendue entre les gènes orthologues (70% d'identité) alors que leurs séquences 18S ont une identité de 99%. La divergence entre ces 3 souches a été comparée avec les divergences de 4 lignées eucaryotes, et souligne le fait que le gène marqueur 18S sous-estime la divergence globale des organismes unicellulaires. La comparaison génomique des 3 Ostreococcus a permis d'identifier les fonctions des gènes orthologues et des gènes spécifiques. L'estimation des taux de substitution entre orthologues a permis d'identifier des gènes candidats à l'origine de l'adaptation de ces organismes à leur environnement, et suggère un rôle majeur des protéines transmembranaires dans l'évolution de ces espèces.

Produktdetails

• Verlag: Éditions universitaires européennes
• Seitenzahl: 192
• Erscheinungstermin: 18. Juli 2011
• Französisch
• Abmessung: 220mm x 150mm x 12mm
• Gewicht: 304g
• ISBN-13: 9786131584848
• ISBN-10: 6131584842
• Artikelnr.: 33718993

Autorenporträt

Severine Jancek, Docteur en biologie, ayant suivi des études debiologie et physiologie intégrative, et adaptation des organismesà l'environnement marin à l'Université de Pierre et Marie Curiede Paris. Chercheur postdoc CNRS en génomique comparative etadaptative à l'Institut de Recherche sur la Biologie del'Insecte, Tours (France).