Fabricio Araujo

Simulac¿a¿o de dados de experimentos de mapping by sequencing

Um pipeline de simulac¿a¿o de dados de experimentos de mapping by sequencing em Arabidopsis thaliana

• Broschiertes Buch

Produktbeschreibung

Avanc¿os recentes nas tecnologias de sequenciamento de nova gerac¿äo (NGS) reduziram o tempo necessärio para a identificac¿äo de mutac¿o¿es em gene¿tica forward, uma das principais formas para caracterizac¿äo da func¿äo de genes em plantas. A metodologia utilizada para a identificac¿äo de mutac¿o¿es induzidas por agentes mutage¿nicos fi¿sicos ou qui¿micos em uma populac¿äo de mapeamento e¿ conhecida como mapping-by-sequencing. Dentre as värias te¿cnicas que utilizam esta metodologia, Next-generation mapping (NGM) ganha destaque por necessitar de um nu¿mero pequeno de mutantes na populac¿äo de mapeamento. Entretanto, nos trabalhos publicados, näo fica claro o porque¿ da utilizac¿äo dos parämetros usados para formac¿äo da populac¿äo de mapeamento (nu¿mero de indivi¿duos, nu¿mero de mutantes, forma de cruzamento) e para o sequenciamento (plataforma utilizada, me¿todo de sequenciamento, cobertura) nos experimentos. Por isso, desenvolveu-se um pipeline de bioinformätica que possibilita a simulac¿äo de dados de experimentos que utilizam a te¿cnica de NGM com a planta modelo Arabidopsis thaliana, uma das plantas mais estudas e sequenciadas na literatura.

Produktdetails

• Verlag: Novas Edicioes Academicas / Novas Edições Acadêmicas
• Seitenzahl: 60
• Erscheinungstermin: 23. September 2017
• Portugiesisch
• Abmessung: 220mm x 150mm x 4mm
• Gewicht: 107g
• ISBN-13: 9783330771130
• ISBN-10: 3330771135
• Artikelnr.: 49475508

Autorenporträt

Possui graduação em Sistemas de Informação pela Universidade Federal do Pará (2010) e mestrado em Genética e Biologia Molecular pela Universidade Federal do Pará (2016). Atualmente é bolsista de doutorado da Universidade Federal do Pará. Tem experiência na área de Genética, com ênfase em Bioinformatica.