Este trabalho desenvolve um modelo teórico para o experimento de eletroporação, método de envio de substâncias para o meio intracelular. A motivação foi a possibilidade de tratar doenças cardíacas isquêmicas usando células-tronco. Além disso, o modelo é usado para simular experimentos de eletroporação, visando o planejamento e conhecimento de variáveis do processo, para reduzir custos com experimentos práticos. Foi realizada uma simulação de um protocolo de pulso único de campo elétrico para comparação com o modelo referência. Foram simulados protocolos de dois pulsos para a análise do controle do raio do poro pela manipulação do padrão de aplicação dos pulsos. A comparação dos resultados da simulação de pulso único com os resultados do modelo usado como referência corrobora o simulador desenvolvido neste trabalho. Os resultados da simulação de pulso duplo permitem avaliar a influência de algumas variáveis do sistema no controle do tamanho dos raios dos poros formados na membranacelular.