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Os países em desenvolvimento como o Brasil vêm sofrendo com um grande problema, que é a poluição de seus mananciais pela ausência ou má operação de estações de tratamento de esgoto, que acabam lançando águas com elevado potencial poluidor no solo e nos cursos d'água, deteriorando a qualidade ambiental com efeitos muitas vezes irreversíveis ao ecossistema aquático e riscos a saúde humana. No enfrentamento desse problema, o uso de tecnologias baseadas em microrganismos e/ou agregados microbianos tem proporcionado uma ampla gama de estratégias úteis e promissoras para degradar diversos tipos de poluentes, como matéria orgânica e nitrogênio, sendo estes os principais poluentes das águas residuárias, que é de interesse para a remoção e proteção dos corpos hídricos. Diante desse contexto se faz conveniente avaliar a capacidade de remover matéria orgânica e nutrientes no sistema de lodo ativado convencional (lodo floculento) e no sistema aeróbio granular alimentados com o mesmo efluente, podendo ser possível avaliar eficiência, confiabilidade, sustentabilidade entre as tecnologia com reatores de biomassa floculenta e de lodo granular este último, uma nova tecnologia que se mostra inovadora.