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Las flavanonas tienen el esqueleto de la estructura del 2-fenil benzopirano-4-ona. Son isómeros de las chalconas que se forman a partir de estas últimas por la acción de las isomerasas de chalcona in vivo. La estereoquímica en C-3 es la configuración (3s) para todas las flavanonas naturales. Los intermediarios clave en la síntesis de todos los flavonoides son los isómeros de chalcona/flavanona. La presencia conjunta de muchos compuestos de la clase de los flavonoides en las plantas indica su estrecha relación biogenética. Las flavanonas coexisten ocasionalmente con las chalconas, ya que son isómeras y fácilmente interconvertibles.