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La struttura genetica della popolazione può essere definita come la distribuzione temporale delle frequenze geniche e genotipiche di una popolazione. A sostegno dell'isolamento tramite il modello di distanza di Wright (1943), le simulazioni di Wright (1943) mostrano che, in presenza di un flusso genico limitato e di una neutralità selettiva, la popolazione nel suo insieme sviluppa una distribuzione frammentaria dei genotipi. In questo studio 3 popolazioni di Picrorhiza kurrooa sono state campionate da habitat che possono avere diversi processi geologici storici. La regione oggetto di studio è un territorio montuoso fisiograficamente complesso, quindi rappresenta un eccellente sistema modello per studiare l'effetto delle catene montuose come barriere al flusso genico interpopolare. Una popolazione si trovava nell'Himalaya maggiore (catena del Ladakh) e si trova a nord dell'Himalaya principale, le altre 2 popolazioni sono state raccolte dagli himalayani medi (Sonamarg e Gurez) a sud del terreno himalayano. L'analisi spaziale della struttura genetica della popolazione da parte della RAPD fornisce importanti informazioni genetiche molecolari sui modelli di frammentazione e sulla genetica del paesaggio che modellano la struttura genetica della popolazione e la variazione genetica adattiva nelle popolazioni naturali di Picrorhiza kurrooa.